數碼印花相對于傳統的平網、圓網印花的發展時間還是比較短的。無論在設備生產上，還是工藝技術應用方面，都還存在一些缺陷。在實際應用的過程中，還有不少產品質量問題產生。
一、調色方法不科學：
傳統印花采用色塊逐色對顏色進行調整，數碼印花用四分色原理混色，所以只能在計算機上進行顏色調整。目前，大部分的數碼調色人員都采用Photoshop軟件進行調色，而Photoshop軟件的調色，主要是針對印刷行業的油墨和紙張，其參數對紡織品而言不夠科學。此外，調色人員完全靠個人經驗進行調色，與數碼印花的先進設備完全不匹配。
二、顏色重演性較差：
重演性不好主要有兩大原因：一方面是由四分色原理決定的，四分色的混色原理是通過青、品紅、黃的反射光在空間混合后形成了二次色或三次色。因此，只要青、品紅、黃中的三個顏色中有任何一個顏色發生改變，所混合出來的顏色就會產生很大變化。
另一方面是由
活性染料影響的，現在數碼印花用的活性染料墨水，大部分是高溫K型染料，這類染料對濕度的敏感度很高，空氣中的濕度、蒸箱箱體內的濕度、織物含水率，其中一個因素不一致的話，都會顯著影響數碼印花的色光。
三、顏色鮮艷度不夠高：
如果數碼印花的顏色是三次色的青灰、咖啡、墨綠等為主的話，也就是說一種色彩，需要青、品紅、黃、黑中的三個或四個墨水拼混出來的。那么，顏色的鮮艷度就會變差。這是因為青、品紅、黃三個顏色混合后，會產生一定的灰度。
印花的顏色大部分都是三次色，需要青、品紅、黃、黑中的三個或四個墨水拼混出來，會產生一定的灰度，其噴印后的產品，鮮艷度不夠好。
除顏色拼混引起的顏色鮮艷度差外，用活性染料進行數碼噴印，也會引起顏色鮮艷度變差，原因有以下幾點：漿料吸水滲化；面料和染料的吸水滲化；三原色染料色光不標準；活性染料的黑色墨水問題。
四、墨滴大小無法按花型調節：
現在市售的數碼印花機，很多都能實現墨滴大小可以調節。但這種調節完全是整體墨滴調節，即調節墨滴５ＰＬ噴印時，所有噴嘴可以按５ＰＬ供給；調節墨滴５０ＰＬ噴印時，所有噴嘴墨滴大小全是５０ＰＬ。
數碼印花無法根據花型的不同情況，自動按塊面和線條的不同部位來更改變噴墨量的大小。這樣，就無法滿足花樣不同部位的差異性，它會使花型的美感大大降低。
五、上漿體系不夠完善：
主要是上漿設備和助劑兩大方面都要完全滿足數碼印花的需要。然而，在上漿均勻性、緯斜控制、速度、按需上漿等方面沒有很好的專用設備;助劑也缺少個性化。
希望今后在數碼印花發展的過程中，能不斷進行完善改進，如開發出可以按照花型不同部位要求，自動調節墨滴大小的噴嘴和控制軟件；開發出質量更好的上漿設備和助劑，完善上漿體系；研究出科學的調色方法，降低對調色人員經驗的依賴程度；研究出一套完善的工藝技術和專用助劑，使數碼印花的顏色重演性和鮮艷度得到提高。
